Lyon (France), june 27^th-28^th, 2013

Planning

Week Thu. 27 Fri. 28 List

	Thu. 27	Fri. 28
09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00 18:00 19:00 20:00 21:00 22:00 23:00	Opening 9:00 - 9:15 (15min) Opening Grand Amphi https://r2013-lyon.sciencesconf.org/data/program/presentation.pdf Invited conference 9:15 - 10:15 (1h) Invited conference Grand Amphi › Visualising big data in R - Hadley Wickham, RStudio 09:15-10:15 (1h) Graphics & Visualization Applied statistics 10:15 - 11:15 (1h) Graphics & Visualization Grand Amphi › L'analyse de données avec FactoMineR : les nouveautés - François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes 10:15-10:35 (20min) › rCarto, un package de cartographie statistique - Timothée Giraud, Unité Mixte de Service Réseau Interdisciplinaire pour l'Aménagement du Territoire Européen 10:35-10:55 (20min) › adegraphics : un package pour la représentation et l'analyse de données multivariées - Aurélie Siberchicot, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 10:55-11:15 (20min) 10:15 - 11:15 (1h) Applied statistics Petit Amphi › Développement d'une application sous R pour la Surveillance Observationnelle des Problèmes de Santé au Travail - Delphine Rieutort, Environnement et Prédiction de la Santé des Populations 10:15-10:35 (20min) › Estimation des données manquantes en morphométrie : quelle limite choisir ? - Julien Clavel, Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement 10:35-10:55 (20min) › Prédiction de la réactivité du glycérol sur les catalyseurs métalliques - Jeremie Zaffran, École normale supérieure de Lyon 10:55-11:15 (20min) Coffee break 11:15 - 11:45 (30min) Coffee break sess_4216 Data Analysis 11:45 - 12:25 (40min) sess_4216 Grand Amphi › What a statistician might want to know about human color vision, but was afraid to ask! - Kenneth Knoblauch, Stem Cell and Brain Research Institute 11:45-12:05 (20min) › KmL3D: K-means pour données longitudinales jointes - Christophe Genolini, CeRSM (EA 2931), UFR STAPS, Université de Paris Ouest-Nanterre-La Défense, France, UMR 1027, INSERM, Université Paul Sabatier, Toulouse III, France 12:05-12:25 (20min) 11:45 - 12:25 (40min) Data Analysis Petit Amphi › MFAMIX : une extension de l'analyse factorielle multiple pour des groupes de variables mixtes - Amaury Labenne, Aménités et dynamiques des espaces ruraux 11:45-12:05 (20min) › Méthodes de couplage de deux K-tableaux et collections de graphiques - Jean Thioulouse, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 12:05-12:25 (20min) Lunch 12:25 - 14:00 (1h35) Lunch Poster 14:00 - 14:15 (15min) Poster Grand Amphi › aste: An R package for the adaptive estimation the right tail - Frederico Caeiro, Faculdade de Ciências e Tecnologia & CMA 14:00-14:15 (15min) › Cascade : un package R pour étudier la dispersion d'un signal dans un réseau de gènes. - Frédéric Bertrand, Laboratoire d'Excellence IRMIA, Institut de Recherche en Mathématique Avancée 14:00-14:15 (15min) › Corrélations entre maillages 3D au moyen du logiciel R application à l'imagerie par IRM de l'accident vasculaire cérébral - David ROUSSEAU, Département GEII, IUT, Université Lyon 1 14:00-14:15 (15min) › Corrélations entre signaux EEG : un code d'analyse parallélisé - Anne Cheylus, Laboratoire sur le langage, le cerveau et la cognition 14:00-14:15 (15min) › Parallel Computing in R using the Bot Package - Florent Chuffart, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule 14:00-14:15 (15min) › Un package pour utiliser les Cumulative Distribution Networks - Van Trung Pham, Laboratoire Jean Kuntzmann 14:00-14:15 (15min) › Visualisation de processus spatiaux à l'aide de la correction de Ripley - 14:00-14:15 (15min) › Visualisation et cartographie des données de capteurs météorologiques à l'échelle des terroirs viticoles - Malika Madelin, Université Paris Diderot - Sorbonne Paris-Cité, UMR 8586 PRODIG CNRS 14:00-14:15 (15min) Invited conference 14:15 - 15:15 (1h) Invited conference Grand Amphi › R and the Cloud - Karim Chine, Cloud Era Ltd 14:15-15:15 (1h) High performance computing Health & biostatistics 15:15 - 16:15 (1h) High performance computing Grand Amphi › R2GUESS: a GPU-based R package for sparse Bayesian variable selection - Habib Saadi, Department of Epidemiology and Biostatistics, Imperial College London 15:15-15:35 (20min) › An R package using HPC for entropy estimation and MCMC evaluation - Didier Chauveau, Laboratoire MAPMO - Fédération Denis Poisson 15:35-15:55 (20min) › Intégration R et C++ avec Rcpp - Romain Francois, Consultant 15:55-16:15 (20min) 15:15 - 16:15 (1h) Health & biostatistics Petit Amphi › frailtypack : Un package pour l'analyse de données de survie corrélées - 15:15-15:35 (20min) › The Dataset Project: Handling survey data in R - Emmanuel Rousseaux, PRN LIVES, Institut d'études démographiques et du parcours de vie, Institut de science des services 15:35-15:55 (20min) › Sample Size Determination and Data Analysis in the context of continuous co-primary endpoints in clinical trials. - Jeremie Riou, Danone Research 15:55-16:15 (20min) Coffee break 16:15 - 16:45 (30min) Coffee break Invited conference 16:45 - 17:45 (1h) Invited conference Grand Amphi › R as a sound system - Jérôme SUEUR, Muséum national d'histoire naturelle 16:45-17:45 (1h) Buffet diner 19:30 - 23:30 (4h) Buffet diner	Invited conference 9:00 - 10:00 (1h) Invited conference Grand Amphi › L'approche par comparaison de modèles avec R2STATS dans l'enseignement des statistiques en sciences humaines - Yvonnick NOEL, Centre de Recherches en Psychologie, Cognition et Communication 09:00-10:00 (1h) Teaching Genomic data analysis 10:00 - 11:20 (1h20) Teaching Grand Amphi › Un site web d'enseignement R automatisé et à gestion partagée - Simon Penel, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 10:00-10:20 (20min) › Génération automatique de documents pédagogiques avec R pour l'enseignement et l'évaluation des étudiants. - Sylvain Mousset, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 10:20-10:40 (20min) › Pistes de réflexion pour la mise en œuvre d'un enseignement à distance sur le test du khi carré d'indépendance pour des étudiants en master de sciences de l'éducation - mehdi khaneboubi, Laboratoire EMA 10:40-11:00 (20min) › De la biologie à l'algèbre linéaire ... en passant par R. Expérimenter la notion de projection. - Anne-Béatrice Dufour, Université Lyon 1 - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 11:00-11:20 (20min) 10:00 - 11:00 (1h) Genomic data analysis Petit Amphi › metaRNASeq: un package pour la méta-analyse de données RNASeq - Guillemette Marot, Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale, MODAL 10:00-10:20 (20min) › jointSeg : Segmentation de données génomiques en cancérologie - Morgane Pierre-Jean, Laboratoire Statistique et génomes, Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale 10:20-10:40 (20min) › HTSFilter: An independent data-based filter for replicated high-throughput transcriptome sequencing experiments - Andrea Rau, UMR 1313 GABI 10:40-11:00 (20min) Coffee break 11:20 - 11:45 (25min) Coffee break sess_4217 sess_4218 11:45 - 12:30 (45min) sess_4217 Grand Amphi › Aspects de cartographie thématique pour les sciences sociales avec R - Joël Gombin, Centre universitaire de recherches sur l'action publique et le politique. Epistémologie et Sciences sociales 11:45-11:50 (05min) › Nouvelles fonctionnalités du package fitdistrplus - Marie Laure Delignette-Muller, Université de Lyon 11:50-11:55 (05min) › SesIndexCreatoR : Un package R pour la création et la visualisation d'indices socioéconomiques - Benoit Lalloué, BIGS, Institut Élie Cartan de Lorraine, Institut de recherche, santé, environnement et travail, Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique 11:55-12:00 (05min) › PNN : une nouvelle bibliothèque R pour la modélisation d'un réseau de neurones probabilistes de Specht - Pierre-Olivier Chasset, Chercheur en transport, flux et mouvement 12:00-12:05 (05min) › Estimation des risques dans les formes familiales de cancer. - Youenn Drouet, Unité de Prévention et d'Epidémiologie Génétique - Centre Léon Bérard 12:05-12:10 (05min) › Prévision de consommation électrique avec R - Raphaël Nedellec, EDF R&D 12:10-12:15 (05min) › autoplot : ready-made plots with ggplot2 - Jean-Olivier Irisson, Laboratoire d'océanographie de Villefranche 12:15-12:20 (05min) 11:45 - 12:30 (45min) sess_4218 Petit Amphi › Des analyses exploratoires multidimensionnelles pour prédire la progression des patients en thérapie - tiba delespierre, URC du Kremlin-Bicêtre, Unité INSERM 669 11:45-11:50 (05min) › R au secours des écotoxicologues - Guillaume KON KAM KING, Laboratoire de Biométrie - Biologie Evolutive 11:50-11:55 (05min) › Analyse et datation d'artefacts archéolgiques: R et les cachets circulaires hittites - Nehemie Strupler, Archéologie et Histoire ancienne : Méditerranée-Europe (ARCHIMÈDE) 11:55-12:00 (05min) › Teaching R to social science undergraduates - François Briatte, Politiques publiques, ACtion politique, TErritoires 12:00-12:05 (05min) › R tools for spatial point pattern analysis applied to fluorescence localization nanoscopy - Julien Godet, Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie - UMR 7213 12:05-12:10 (05min) › Traiter des données de tracking – navigation web, suivi d'enquête – avec R - Anne GAYET, A.I.D. 12:10-12:15 (05min) › Rendre R plus accessible aux utilisateurs non-informaticiens - Jean-Paul Maalouf, AnaStats Scop ARL 12:15-12:20 (05min) Lunch An R user group @Lyon ? 12:30 - 14:00 (1h30) Lunch 13:45 - 14:00 (15min) An R user group @Lyon ? Grand Amphi Invited conference 14:00 - 15:00 (1h) Invited conference Grand Amphi › TraMineR : Une boite à outils pour l'exploration et la visualisation de séquences - Gilbert Ritschard, PRN LIVES, Institut d'études démographiques et du parcours de vie, Université de Genève 14:00-15:00 (1h) Mixed models Clustering 15:00 - 16:00 (1h) Mixed models Grand Amphi › multlcmm : fonction d'estimation de modèles mixtes à processus latent pour données longitudinales - 15:00-15:20 (20min) › Prédiction d'un événement binaire à partir de données fonctionnelles : Application aux bovins laitiers - Cécile Sauder, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage 15:20-15:40 (20min) › Données tronquées sous R dans les modèles linéaires simples et à effets mixtes - DJENEBA THIAM, Mathématiques appliquées Paris 5 15:40-16:00 (20min) 15:00 - 16:00 (1h) Clustering Petit Amphi › Rankclust: An R package for clustering multivariate partial rankings - Quentin Grimonprez, MODAL - Julien Jacques, Polytech'Lille, Laboratoire Paul Painlevé, MODAL 15:00-15:20 (20min) › SOMbrero: Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités - Nathalie Villa-Vialaneix, INRA, UR875, MIAT, Statistique, Analyse et Modélisation Multidisciplinaire (SAmos-Marin Mersenne) 15:20-15:40 (20min) › The data.sample package: sampling as a big data mining tool - Matthieu Cornec, Cdiscount 15:40-16:00 (20min) Coffee break 16:00 - 16:30 (30min) Coffee break Dynamic document & Graphical interface 16:30 - 17:30 (1h) Dynamic document & Graphical interface Grand Amphi › Génération de documents Word à partir de R : utilisation du package R2DOCX dans une plateforme statistique en milieu industriel. - David Gohel, Société Lysis 16:30-16:50 (20min) › sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner - 16:50-17:10 (20min) › R-dyndoc une alternative à Sweave - Rémy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann 17:10-17:30 (20min) Closure 17:30 - 17:45 (15min) Closure Grand Amphi

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